Progrès récents sur les cortinaires du Québec

par Jacques Landry

Près de 100 nouvelles espèces de cortinaires ont été ajoutées à l’Index des champignons du Québec au cours des 12 derniers mois suite au séquençage et analyses phylogénétiques de près de 400 collections.

Le projet de Mycoquébec de séquencer le locus ITS de tous les cortinaires du Québec se poursuit. Au 1er mars 2018, l’index des champignons du Québec présenté sur le site de Mycoquébec comptait 238 espèces de cortinaires, lesquelles avaient été identifiées au cours des années selon des caractères morphologiques (phénotypiques) basés le plus souvent sur des monographies européennes ou encore de très courtes descriptions faites par les découvreurs de ces espèces. En 2018, 377 collections déposées au Fongarium du Cercle des mycologues de Montréal ou à l’Herbier René-Pomerleau ont été séquencées et analysées. Il s’agissait de collections réalisées par les mycologues Renée Lebeuf, André Paul, Herman Lambert et Yves Lamoureux et aussi d’une collection d’une centaine de spécimens réalisée lors d’une excursion de Mycoquébec à Anticosti en 2015 et à Chibougamau en 2017. Une analyse phylogénétique de ces séquences a révélé l’existence de 190 espèces distinctes parmi ces collections, dont une centaine ont pu être nommées avec un haut niveau de confiance, alors que les autres, en absence de séquence de référence étaient nommées selon leur ressemblance avec une espèce soeur (cf. ou aff.) ou encore recevaient un numéro unique d’espèce. En tout près d’une centaine d’espèces ont été ajoutées à notre index, dont 44 correspondent à des espèces nouvelles pour le Québec, 24 qui ne peuvent être nommées avec précision mais qui se situent très près d’espèces connues (aff. ou cf.) et une vingtaine d’espèces (19) qui ne ressemblent à rien de ce qui a été séquencé et publié jusqu’à maintenant. L’étude a également permis d’éliminer 52 espèces de l’index dont 8 se voient attribuer le qualificatif de « aff. », n’étant pas exactement l’espèce que l’on croyait.

En 2019, c’est au delà de 600 collections supplémentaires, représentant les 98 dernières espèces non vérifiées de notre index actuel, qui seront séquencées et analysées. On peut s’attendre encore une fois à un ajout important du nombre d’espèces qui pourrait totaliser dans les 350 lorsque nos études seront terminées.

Changement à l’index des Cortinarius en 2018

Le 28 février 2018, l’index Mycoquébec listait 238 taxons de Cortinarius. Un an plus tard, le 6 mars 2019, il en comptait 288, soir 50 de plus. Dans les listes qui suivent, les noms comportant le qualificatif « cf. »  indique que l’espèce est probablement identique à l’espèce indiquée, mais que cette détermination demeure incertaine soit à cause de caractères morphologiques discordants ou encore d’un manque de données moléculaires probantes. C’est la même chose pour le qualificatif « aff. » sauf que dans ces cas, il y a de bonnes raisons de penser que l’espèce est différente de celle indiquée. Les espèces dénommées Cortinarius sp.(IUMQxxxx, XXXX) correspondent à des espèces très bien délimitées au niveau moléculaire comme phénotypique, mais qui semble ne correspondre à rien de connu ou du moins, à rien dont la séquence a été publiée. Plusieurs parmi celles-ci seront nommées sous peu grâce à des collaborations avec des chercheurs qui sont à séquencer des collections types américaines. Entre parenthèses, le numéro IUMQ correspond à l’identificateur unique Mycoquébec est suivi du groupe infragénique correspondant à l’espèce.

Espèces nouvelles ajoutées

A. Identité établie d’après une séquence de référence de confiance
(par. ex.  : séquence d’un holotype)

  1. Cortinarius alboluteus
  2. Cortinarius areni-silvae
  3. Cortinarius aurantiobasis
  4. Cortinarius aurantiomarginatus
  5. Cortinarius aureovelatus
  6. Cortinarius bataillei
  7. Cortinarius boulderensis
  8. Cortinarius caesioarmeniacus
  9. Cortinarius caesiophylloides
  10. Cortinarius cinnamomeus
  11. Cortinarius croceoconus
  12. Cortinarius davemallochii
  13. Cortinarius elotoides
  14. Cortinarius fennoscandicus
  15. Cortinarius fulvescentoideus
  16. Cortinarius glaucocyanopus
  17. Cortinarius glutinosus
  18. Cortinarius hadrocroceus
  19. Cortinarius hedyaromaticus
  20. Cortinarius herpeticus f. altaicus
  21. Cortinarius illibatus
  22. Cortinarius impennoides
  23. Cortinarius infractiflavus
  24. Cortinarius leiocastaneus
  25. Cortinarius montebelloensis
  26. Cortinarius neocallisteus
  27. Cortinarius ominosus
  28. Cortinarius orasericeus
  29. Cortinarius oxytoneus
  30. Cortinarius pallidifolius
  31. Cortinarius paludosaniosus
  32. Cortinarius pellstonianus
  33. Cortinarius piceidisjungendus
  34. Cortinarius purpureus
  35. Cortinarius riederi
  36. Cortinarius sobrius
  37. Cortinarius solis-occasus
  38. Cortinarius subolivascens
  39. Cortinarius tortuosus
  40. Cortinarius umbilicatus
  41. Cortinarius violaceorubens

B. Identité incertaine, mais apparentée à une espèce connue

  1. Cortinarius aff. albovariegatus
  2. Cortinarius aff. alboviolaceus
  3. Cortinarius aff. balteatocumatilis
  4. Cortinarius aff. boreicyanites
  5. Cortinarius aff. bulliardii
  6. Cortinarius aff. cagei
  7. Cortinarius aff. fulminoides
  8. Cortinarius aff. luteoarmillatus
  9. Cortinarius aff. magicus
  10. Cortinarius aff. multiformis
  11. Cortinarius aff. nanceiensis
  12. Cortinarius aff. olearioides
  13. Cortinarius aff. persoonianus
  14. Cortinarius aff. psammocola
  15. Cortinarius aff. purpureus
  16. Cortinarius aff. rigens
  17. Cortinarius aff. superbus
  18. Cortinarius aff. tabularis
  19. Cortinarius aff. torvus
  20. Cortinarius aff. vernus
  21. Cortinarius aff. violaceomaculatus
  22. Cortinarius cf. amnicola
  23. Cortinarius cf. emollitus
  24. Cortinarius cf. uraceus

C. Identité inconnue. Ne s’apparente à rien dont la séquence est publiée.

  1. Cortinarius sp. (IUMQ3104, Anomali)
  2. Cortinarius sp. (IUMQ3586, Calochroi)
  3. Cortinarius sp. (IUMQ3587, Scauri)
  4. Cortinarius sp. (IUMQ3589, Delibuti)
  5. Cortinarius sp. (IUMQ3590, Delibuti)
  6. Cortinarius sp. (IUMQ3599, Anomali)
  7. Cortinarius sp. (IUMQ3601, Incrustati)
  8. Cortinarius sp. (IUMQ3602, Fulvescentes)
  9. Cortinarius sp. (IUMQ3603, Fulvescentes)
  10. Cortinarius sp. (IUMQ3604, Obtusi)
  11. Cortinarius sp. (IUMQ3609, Firmiores)
  12. Cortinarius sp. (IUMQ3611, Calochroi)
  13. Cortinarius sp. (IUMQ3614, Saturnini)
  14. Cortinarius sp. (IUMQ3618, Incertain)
  15. Cortinarius sp. (IUMQ3627, Firmiores)
  16. Cortinarius sp. (IUMQ3628, Elastici-Percomes)
  17. Cortinarius sp. (IUMQ3634, Telamonia)
  18. Cortinarius sp. (IUMQ3640, Anomali)
  19. Cortinarius sp. (IUMQ3641, Anomali)
  20. Cortinarius sp. (IUMQ447, Delibuti

Espèces enlevées de l’Index.

Ces taxons ont été enlevés ou changés de nom (⇒ )
  1. Cortinarius aff. aurilicis
  2. Cortinarius albidifolius
  3. Cortinarius amurceus
  4. Cortinarius anomalochrascens
  5. Cortinarius balteatocumatilis ⇒  aff. balteatocumatilis
  6. Cortinarius balteatocumatilis var. laetus
  7. Cortinarius bibulus
  8. Cortinarius bulliardii ⇒ aff. bulliardii
  9. Cortinarius caesiocanescens
  10. Cortinarius caesiostramineus
  11. Cortinarius cagei ⇒ aff. cagei
  12. Cortinarius calochrous var. carolii
  13. Cortinarius caput-medusae
  14. Cortinarius cinnabarinus
  15. Cortinarius citrinus
  16. Cortinarius clarobrunneus
  17. Cortinarius croceocaeruleus
  18. Cortinarius depressus
  19. Cortinarius duracinus
  20. Cortinarius epipoleus
  21. Cortinarius flos-paludis
  22. Cortinarius glaucopus var acyaneus
  23. Cortinarius gracilior
  24. Cortinarius helobius
  25. Cortinarius impennis
  26. Cortinarius incognitus
  27. Cortinarius inopinatus Y. Lamoureux nom. prov. ⇒  Cortinarius subolivascens
  28. Cortinarius lilacifolius Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius aff. magicus
  29. Cortinarius livido-ochraceus
  30. Cortinarius luteus
  31. Cortinarius metarius
  32. Cortinarius mucifluus
  33. Cortinarius nanceiensis ⇒ aff. nanceiensis
  34. Cortinarius odorifer var. luteolus
  35. Cortinarius olearioides ⇒ aff. olearioides
  36. Cortinarius olidus
  37. Cortinarius papulosus
  38. Cortinarius pilatii
  39. Cortinarius pseudopraestans Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius aff. praestans
  40. Cortinarius pseudotriumphans Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius sp. (IUMQ3104, Anomali)
  41. Cortinarius pseudotubarius
  42. Cortinarius pulchrifolius var. odorifer
  43. Cortinarius scandens
  44. Cortinarius scutulatus
  45. Cortinarius sordescens
  46. Cortinarius subcroceofolius
  47. Cortinarius torvus ⇒ aff. torvus
  48. Cortinarius turgidus
  49. Cortinarius variecolor var. nemorensis
  50. Cortinarius vernus ⇒ aff. vernus
  51. Cortinarius vespertinus
  52. Cortinarius viscidulus

Ce travail a été réalisé en partie grâce à des subventions de Environnement et Changement climatique Canada (Service canadien de la faune) ainsi que de Mycoquébec. Remerciements également à Raymond Archambault, Jean Bérubé, Hélène Bouchard, Pauline Dubé, Herman Lambert, Yves Lamoureux, Renée Lebeuf et à André Paul pour leurs contributions à divers niveaux dans ce travail.

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6 Responses

  1. Helene Poissant

    Bravo quel magnifique travail, si vous avez besoin d’une assistante bénévole passionnée de champignons et ayant un background scientifique, je propose mon à cette magnifique tâche:

    Hélène Poissant, Ph.D. mon courriel: helenepoissant@gmail.com

  2. Suzanne béland

    Impressionnant comme charge de travail! 350 sortes de cortinaires maintenant sur le site… comment faire pour reconnaître et retenir tous ces noms. Il faudrait des sous-classes pour se comprendre et gérer tout cela. Excellent boulot à toute l’équipe!

    • Jacques Landry

      Merci Suzanne. Les cortinaires sont divisés en sous-genres et en section. C’est mon intention de les diviser ainsi sur Mycoquébec lorsque l’examen de 600 collections suivantes sera terminées.

  3. Loulou Fortin

    Félicitations à toute l’équipe pour ce travail colossal. C’est une immense base de données et déjà c’était pas facile les Cortinaires. Je crois que l’on va y aller un jour à la fois pour assimiler tout ça car ce sont des changements majeurs, Il faudra faire aller nos méninges…

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