Progrès récents sur les cortinaires du Québec

par Jacques Landry

Près de 100 nouvelles espèces de cortinaires ont été ajoutées à l’Index des champignons du Québec au cours des 12 derniers mois suite au séquençage et analyses phylogénétiques de près de 400 collections.

Le projet de Mycoquébec de séquencer le locus ITS de tous les cortinaires du Québec se poursuit. Au 1er mars 2018, l’index des champignons du Québec présenté sur le site de Mycoquébec comptait 238 espèces de cortinaires, lesquelles avaient été identifiées au cours des années selon des caractères morphologiques (phénotypiques) basés le plus souvent sur des monographies européennes ou encore de très courtes descriptions faites par les découvreurs de ces espèces. En 2018, 377 collections déposées au Fongarium du Cercle des mycologues de Montréal ou à l’Herbier René-Pomerleau ont été séquencées et analysées. Il s’agissait de collections réalisées par les mycologues Renée Lebeuf, André Paul, Herman Lambert et Yves Lamoureux et aussi d’une collection d’une centaine de spécimens réalisée lors d’une excursion de Mycoquébec à Anticosti en 2015 et à Chibougamau en 2017. Une analyse phylogénétique de ces séquences a révélé l’existence de 190 espèces distinctes parmi ces collections, dont une centaine ont pu être nommées avec un haut niveau de confiance, alors que les autres, en absence de séquence de référence étaient nommées selon leur ressemblance avec une espèce soeur (cf. ou aff.) ou encore recevaient un numéro unique d’espèce. En tout près d’une centaine d’espèces ont été ajoutées à notre index, dont 44 correspondent à des espèces nouvelles pour le Québec, 24 qui ne peuvent être nommées avec précision mais qui se situent très près d’espèces connues (aff. ou cf.) et une vingtaine d’espèces (19) qui ne ressemblent à rien de ce qui a été séquencé et publié jusqu’à maintenant. L’étude a également permis d’éliminer 52 espèces de l’index dont 8 se voient attribuer le qualificatif de « aff. », n’étant pas exactement l’espèce que l’on croyait.

En 2019, c’est au delà de 600 collections supplémentaires, représentant les 98 dernières espèces non vérifiées de notre index actuel, qui seront séquencées et analysées. On peut s’attendre encore une fois à un ajout important du nombre d’espèces qui pourrait totaliser dans les 350 lorsque nos études seront terminées.

Changement à l’index des Cortinarius en 2018

Le 28 février 2018, l’index Mycoquébec listait 238 taxons de Cortinarius. Un an plus tard, le 6 mars 2019, il en comptait 288, soir 50 de plus. Dans les listes qui suivent, les noms comportant le qualificatif « cf. »  indique que l’espèce est probablement identique à l’espèce indiquée, mais que cette détermination demeure incertaine soit à cause de caractères morphologiques discordants ou encore d’un manque de données moléculaires probantes. C’est la même chose pour le qualificatif « aff. » sauf que dans ces cas, il y a de bonnes raisons de penser que l’espèce est différente de celle indiquée. Les espèces dénommées Cortinarius sp.(IUMQxxxx, XXXX) correspondent à des espèces très bien délimitées au niveau moléculaire comme phénotypique, mais qui semble ne correspondre à rien de connu ou du moins, à rien dont la séquence a été publiée. Plusieurs parmi celles-ci seront nommées sous peu grâce à des collaborations avec des chercheurs qui sont à séquencer des collections types américaines. Entre parenthèses, le numéro IUMQ correspond à l’identificateur unique Mycoquébec est suivi du groupe infragénique correspondant à l’espèce.

Espèces nouvelles ajoutées

A. Identité établie d’après une séquence de référence de confiance
(par. ex.  : séquence d’un holotype)

1. Cortinarius alboluteus
2. Cortinarius areni-silvae
3. Cortinarius aurantiobasis
4. Cortinarius aurantiomarginatus
5. Cortinarius aureovelatus
6. Cortinarius bataillei
7. Cortinarius boulderensis
8. Cortinarius caesioarmeniacus
9. Cortinarius caesiophylloides
10. Cortinarius cinnamomeus
11. Cortinarius croceoconus
12. Cortinarius davemallochii
13. Cortinarius elotoides
14. Cortinarius fennoscandicus
15. Cortinarius fulvescentoideus
16. Cortinarius glaucocyanopus
17. Cortinarius glutinosus
18. Cortinarius hadrocroceus
19. Cortinarius hedyaromaticus
20. Cortinarius herpeticus f. altaicus
21. Cortinarius illibatus
22. Cortinarius impennoides
23. Cortinarius infractiflavus
24. Cortinarius leiocastaneus
25. Cortinarius montebelloensis
26. Cortinarius neocallisteus
27. Cortinarius ominosus
28. Cortinarius orasericeus
29. Cortinarius oxytoneus
30. Cortinarius pallidifolius
31. Cortinarius paludosaniosus
32. Cortinarius pellstonianus
33. Cortinarius piceidisjungendus
34. Cortinarius purpureus
35. Cortinarius riederi
36. Cortinarius sobrius
37. Cortinarius solis-occasus
38. Cortinarius subolivascens
39. Cortinarius tortuosus
40. Cortinarius umbilicatus
41. Cortinarius violaceorubens

B. Identité incertaine, mais apparentée à une espèce connue

1. Cortinarius aff. albovariegatus
2. Cortinarius aff. alboviolaceus
3. Cortinarius aff. balteatocumatilis
4. Cortinarius aff. boreicyanites
5. Cortinarius aff. bulliardii
6. Cortinarius aff. cagei
7. Cortinarius aff. fulminoides
8. Cortinarius aff. luteoarmillatus
9. Cortinarius aff. magicus
10. Cortinarius aff. multiformis
11. Cortinarius aff. nanceiensis
12. Cortinarius aff. olearioides
    
13. Cortinarius aff. persoonianus
    
14. Cortinarius aff. psammocola
    
15. Cortinarius aff. purpureus
    
16. Cortinarius aff. rigens
    
17. Cortinarius aff. superbus
18. Cortinarius aff. tabularis
19. Cortinarius aff. torvus
20. Cortinarius aff. vernus
21. Cortinarius aff. violaceomaculatus
22. Cortinarius cf. amnicola
23. Cortinarius cf. emollitus
24. Cortinarius cf. uraceus

C. Identité inconnue. Ne s’apparente à rien dont la séquence est publiée.

1. Cortinarius sp. (IUMQ3104, Anomali)
   
2. Cortinarius sp. (IUMQ3586, Calochroi)
   
3. Cortinarius sp. (IUMQ3587, Scauri)
   
4. Cortinarius sp. (IUMQ3589, Delibuti)
   
5. Cortinarius sp. (IUMQ3590, Delibuti)
   
6. Cortinarius sp. (IUMQ3599, Anomali)
   
7. Cortinarius sp. (IUMQ3601, Incrustati)
   
8. Cortinarius sp. (IUMQ3602, Fulvescentes)
   
9. Cortinarius sp. (IUMQ3603, Fulvescentes)
   
10. Cortinarius sp. (IUMQ3604, Obtusi)
    
11. Cortinarius sp. (IUMQ3609, Firmiores)
    
12. Cortinarius sp. (IUMQ3611, Calochroi)
    
13. Cortinarius sp. (IUMQ3614, Saturnini)
    
14. Cortinarius sp. (IUMQ3618, Incertain)
    
15. Cortinarius sp. (IUMQ3627, Firmiores)
    
16. Cortinarius sp. (IUMQ3628, Elastici-Percomes)
    
17. Cortinarius sp. (IUMQ3634, Telamonia)
    
18. Cortinarius sp. (IUMQ3640, Anomali)
    
19. Cortinarius sp. (IUMQ3641, Anomali)
    
20. Cortinarius sp. (IUMQ447, Delibuti

Espèces enlevées de l’Index.

Ces taxons ont été enlevés ou changés de nom (⇒ )

1. Cortinarius aff. aurilicis
2. Cortinarius albidifolius
3. Cortinarius amurceus
4. Cortinarius anomalochrascens
5. Cortinarius balteatocumatilis ⇒  aff. balteatocumatilis
6. Cortinarius balteatocumatilis var. laetus
7. Cortinarius bibulus
8. Cortinarius bulliardii ⇒ aff. bulliardii
9. Cortinarius caesiocanescens
10. Cortinarius caesiostramineus
11. Cortinarius cagei ⇒ aff. cagei
12. Cortinarius calochrous var. carolii
13. Cortinarius caput-medusae
14. Cortinarius cinnabarinus
15. Cortinarius citrinus
16. Cortinarius clarobrunneus
17. Cortinarius croceocaeruleus
18. Cortinarius depressus
19. Cortinarius duracinus
20. Cortinarius epipoleus
21. Cortinarius flos-paludis
22. Cortinarius glaucopus var acyaneus
23. Cortinarius gracilior
24. Cortinarius helobius
25. Cortinarius impennis
26. Cortinarius incognitus
27. Cortinarius inopinatus Y. Lamoureux nom. prov. ⇒  Cortinarius subolivascens
28. Cortinarius lilacifolius Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius aff. magicus
29. Cortinarius livido-ochraceus
30. Cortinarius luteus
31. Cortinarius metarius
32. Cortinarius mucifluus
33. Cortinarius nanceiensis ⇒ aff. nanceiensis
34. Cortinarius odorifer var. luteolus
35. Cortinarius olearioides ⇒ aff. olearioides
36. Cortinarius olidus
37. Cortinarius papulosus
38. Cortinarius pilatii
39. Cortinarius pseudopraestans Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius aff. praestans
40. Cortinarius pseudotriumphans Y. Lamoureux nom. prov. ⇒ Cortinarius sp. (IUMQ3104, Anomali)
41. Cortinarius pseudotubarius
42. Cortinarius pulchrifolius var. odorifer
43. Cortinarius scandens
44. Cortinarius scutulatus
45. Cortinarius sordescens
46. Cortinarius subcroceofolius
47. Cortinarius torvus ⇒ aff. torvus
48. Cortinarius turgidus
49. Cortinarius variecolor var. nemorensis
50. Cortinarius vernus ⇒ aff. vernus
51. Cortinarius vespertinus
52. Cortinarius viscidulus

Ce travail a été réalisé en partie grâce à des subventions de Environnement et Changement climatique Canada (Service canadien de la faune) ainsi que de Mycoquébec. Remerciements également à Raymond Archambault, Jean Bérubé, Hélène Bouchard, Pauline Dubé, Herman Lambert, Yves Lamoureux, Renée Lebeuf et à André Paul pour leurs contributions à divers niveaux dans ce travail.